Publications 2022
Le criblage à haut contenu identifie un rôle critique pour les pili P dans l’adhésion précoce d’Escherichia coli uropathogène aux cellules de la vessie.
Auteurs : Simonet, T., Rutschmann, O., Sharma, K., Nass, T., Pavlou, M., Dubois, A., Knott, G. et McKinney, J.
Preprint : Carré de recherche
DOI : 10.21203/rs.3.rs-2379019/v1
L’antibiotique polymyxine organise le lipopolysaccharide en structures cristallines pour solidifier la membrane bactérienne.
Auteurs : Manioglu, S., Modaresi, S.M., Ritzmann, N., Thoma, J., Overall, S.A., Harms, A., Upert, G., Luther, A., Barnes, A.B., Obrecht, D., Müller, D.J.*, et Hiller, S.*
Publié dans : Nature Communications 2022 Vol. 13
DOI : 10.1038/s41467-022-33838-0
Protéolyse limitée et spectrométrie de masse pour identifier les interactions métabolite-protéine.
Chapitre du livre
Auteurs : Holfeld, A., Quast, J.P., Bruderer, R., Reiter, L., de Souza, N., et Picotti, P.
Publié dans : Methods in Molecular Biology 2023 Vol. 2554
DOI : 10.1007/978-1-0716-2624-5_6
reComBat : élimination des effets de lot dans l’intégration de données d’expression génétique multi-sources à grande échelle
Auteurs : Adamer, M.F.*, Brüningk, S.C.*, Tejada-Arranz, A., Estermann, F., Basler, M. et Borgward, K.
Publié dans : Bioinformatics Advances 2022 Vol. 2 Numéro 1
DOI : 10.1093/bioadv/vbac071
Identification informatique d’un antibiotique systémique pour les bactéries gram-négatives
Auteurs : Miller, R.D.*, Iinishi, A.*, Modaresi, S.M.*, Yoo, B.K.*, Curtis, T.D., Lariviere, P.J., Liang, L., Son, S., Nicolau, S., Bargabos, R., Morrissette, M., Gates, M.F., Pitt, N., Jakob, R.P., Rath, P., Maier, T., Mayutin, A.G., Kaiser, J.T., Niles, S., Karavas, B., Ghiglieri, M., Bowman, S., Rees, D.C., Hiller, S.*, et Lewis, K.*
Publié dans : Nature Microbiology 2022 Vol. 7
DOI : 10.1038/s41564-022-01227-4
INCATE : un partenariat pour renforcer la filière des antibiotiques
Commentaire
Auteurs : Alt, S., Haggstrom, D., Kessmann, H., Kloss, F., Schneider, C.E., Jäger, T., Schwede, T., Brakhage, A., et Dehio, C.
Publié dans : Nature Reviews Drug Discovery 2022
DOI : 10.1038/d41573-022-00138-7
Persistance antibiotique de Brucella abortus intracellulaire
Auteurs : Mode, S.*, Ketterer, M.*, Québatte, M.*, et Dehio, C.
Publié dans : PLoS Negl Trop Dis. 2022 Vol. 16 Numéro 7
DOI : 10.1371/journal.pntd.0010635
L’acquisition d’une résistance à l’amoxicilline cliniquement pertinente chez Streptococcus pneumoniae nécessite un transfert génétique horizontal ordonné de quatre loci.
Auteurs : Gibson, P.S., Bexkens, E., Zuber, S., Cowley, L.A. , et Veening, J.W.
Publié dans : PLoS Pathogens 2022 Vol. 18 Numéro 7
DOI : 10.1371/journal.ppat.1010727
Conception de réseaux de gouttes microfluidiques basée sur des circuits
Auteurs : Rousset, N., Lohasz, C., Boos, J.A., Misun, P.M., Cardes, F., et Hierlemann, A.
Publié dans : Micromachines 2022 Vol. 13 Numéro 7
DOI : 10.3390/mi13071124
Streptococcus pneumoniae résistant à l’amoxicilline peut être resensibilisé en ciblant la voie du mévalonate, comme l’indique le sCRilecs-seq.
Auteurs : Dewachter, L., Dénéréaz, J., Liu, X., de Bakker, V., Costa, C., Baldry, M., Sirard, J.C., et Veening, J.W.
Publié dans : eLife 2022 Vol. 11
DOI : 10.7554/eLife.75607
Mécanismes sous-jacents à la formation et à la dispersion du biofilm de Vibrio cholerae
Article de synthèse
Auteurs : Teschler, J.K., Nadell, C.D., Drescher, K., et Yildiz, F.H.
Publié dans : Revue annuelle de microbiologie 2022 Vol. 76
DOI : 10.1146/annurev-micro-111021-053553
Pseudomonas aeruginosa contracte le mucus pour former rapidement des biofilms dans les voies respiratoires humaines obtenues par génie tissulaire
Auteurs : Rossy, T., Distler, T., Pezoldt, J., Kim, J., Talà, J., Bouklas, N., Deplancke, B., et Persat, A.
Preprint : BioRxiv
DOI : 10.1101/2022.05.26.493615
Extension de la recherche de petites molécules antibactériennes par profilage multidimensionnel
Article de synthèse
Auteurs : Ortmayr, K., de la Cruz Moreno, R., et Zampieri, M.
Publié dans : Nature Chemical Biology 2022 Vol. 18
DOI : 10.1038/s41589-022-01040-4
Criblage à haut débit d’inhibiteurs de BAM dans l’environnement membranaire natif
Auteurs : Rath, P., Hermann, A., Schaefer, R., Agustoni, E., Vonach, JM., Siegrist, M., Miscenic, C., Tschumi, A., Roth, D., Bieniossek, C. et Hiller, S.
Preprint : Carré de recherche
DOI : 10.21203/rs.3.rs-1465417/v1
Combinaison de CRISPRi et de la métabolomique pour l’annotation fonctionnelle des bibliothèques de composés
Auteurs : Anglada-Girotto, M., Handschin, G., Ortmayr, K., Campos, A.I., Gillet, L., Manfredi, P., Mulholland, C.V., Berney, M., Jenal, U., Picotti, P. et Zampieri, M.
Publié dans : Nature Chemical Biology 2022 Vol. 18
DOI : 10.1038/s41589-022-00970-3
Le phage Paride détourne les réponses bactériennes au stress pour tuer les cellules dormantes et tolérantes aux antibiotiques
Auteurs : Maffei, E., Burkolter, M., Heyer, Y., Egli, A., Jenal, U., et Harms, A.
Preprint : BioRxiv
DOI : 10.1101/2022.01.26.477855
CRISPRi-seq pour la quantification de la condition physique à l’échelle du génome chez les bactéries
Auteurs : de Bakker, V.*, Liu, X.*, Bravo, A.M., et Veening, J.W.
Publié dans : Nature Protocols 2022 Vol. 17 Numéro 2
DOI : 10.1038/s41596-021-00639-6
