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Ensembles de données

La RAM est un problème mondial. C’est pourquoi nous adhérons aux principes de la science ouverte et de la collaboration, et nous sommes fiers de publier nos données, afin que les scientifiques du monde entier puissent voir, développer et construire sur la base de notre travail.


Dataset – reComBat : élimination des effets de lot dans l’intégration de données d’expression génétique multi-sources à grande échelle

https://github.com/BorgwardtLab/reComBat
https://github.com/BorgwardtLab/batchCorrectionPublicData


Dataset – Persistance antibiotique de Brucella abortus intracellulaire

doi:10.1371/journal.pntd.0010635.s005
doi:10.5281/zenodo.7043646


Dataset – Combinaison de CRISPRi et de la métabolomique pour l’annotation fonctionnelle des bibliothèques de composés

https://www.nature.com/articles/s41589-022-00970-3#Sec32


Dataset – CRISPRi-seq pour la quantification de la condition physique à l’échelle du génome chez les bactéries

https://github.com/veeninglab/CRISPRi-seq
https://github.com/veeninglab/2FAST2Q/tree/V2.5.0
https://pypi.org/project/fast2q/
doi:10.5281/zenodo.7012813


Dataset – Persistance dynamique des communautés bactériennes intracellulaires d’Escherichia coli uropathogènes dans un modèle d’infections urinaires sur puce de vessie humaine

doi:10.5281/zenodo.5028262


Dataset – L’invasion précoce de la paroi de la vessie par des bactéries solitaires protège les E. coli uropathogènes des antibiotiques et des essaims de neutrophiles dans un modèle organoïde

doi:10.5281/zenodo.4772819


Dataset – L’antibiotique darobactine imite un brin bêta pour inhiber l’insertase de la membrane externe

doi:10.2210/pdb7nre/pdb
doi :10.2210/pdb7nrf/pdb
doi :10.2210/pdb7nri/pdb
EMD-12546
doi:10.6084/m9.figshare.12179784
https://github.com/hiller-lab/kaur-jakob-2021