Veröffentlichungen 2022
High-Content-Screening identifiziert eine entscheidende Rolle für P-Pili bei der frühen Anhaftung von uropathogenen Escherichia coli an Blasenzellen
Die Autoren: Simonet, T., Rutschmann, O., Sharma, K., Nass, T., Pavlou, M., Dubois, A., Knott, G., und McKinney, J.
Vorabdruck: Platz der Forschung
DOI: 10.21203/rs.3.rs-2379019/v1
Das Antibiotikum Polymyxin ordnet das Lipopolysaccharid in kristallinen Strukturen an und verfestigt so die Bakterienmembran
Die Autoren: Manioglu, S., Modaresi, S.M., Ritzmann, N., Thoma, J., Overall, S.A., Harms, A., Upert, G., Luther, A., Barnes, A.B., Obrecht, D., Müller, D.J.*, und Hiller, S.*
Veröffentlicht in: Nature Communications 2022 Vol. 13
DOI: 10.1038/s41467-022-33838-0
Begrenzte Proteolyse-Massenspektrometrie zur Identifizierung von Metabolit-Protein-Interaktionen.
Buchkapitel
Die Autoren: Holfeld, A., Quast, J.P., Bruderer, R., Reiter, L., de Souza, N., und Picotti, P.
Veröffentlicht in: Methods in Molecular Biology 2023 Vol. 2554
DOI: 10.1007/978-1-0716-2624-5_6
reComBat: Beseitigung von Batch-Effekten bei der Integration umfangreicher Gen-Expressionsdaten aus verschiedenen Quellen
Die Autoren: Adamer, M.F.*, Brüningk, S.C.*, Tejada-Arranz, A., Estermann, F., Basler, M., und Borgward, K.
Veröffentlicht in: Bioinformatics Advances 2022 Vol. 2 Ausgabe 1
Computergestützte Identifizierung eines systemischen Antibiotikums für gramnegative Bakterien
Die Autoren: Miller, R.D.*, Iinishi, A.*, Modaresi, S.M.*, Yoo, B.K.*, Curtis, T.D., Lariviere, P.J., Liang, L., Son, S., Nicolau, S., Bargabos, R., Morrissette, M., Gates, M.F., Pitt, N., Jakob, R.P., Rath, P., Maier, T., Mayutin, A.G., Kaiser, J.T., Niles, S., Karavas, B., Ghiglieri, M., Bowman, S., Rees, D.C., Hiller, S.*, und Lewis, K.*
Veröffentlicht in: Nature Microbiology 2022 Vol. 7
DOI: 10.1038/s41564-022-01227-4
INCATE: eine Partnerschaft zur Förderung der Antibiotika-Pipeline
Kommentar
Die Autoren: Alt, S., Haggstrom, D., Kessmann, H., Kloss, F., Schneider, C.E., Jäger, T., Schwede, T., Brakhage, A., und Dehio, C.
Veröffentlicht in: Nature Reviews Drug Discovery 2022
DOI: 10.1038/d41573-022-00138-7
Antibiotikaresistenz von intrazellulären Brucella abortus
Die Autoren: Mode, S.*, Ketterer, M.*, Québatte, M.*, und Dehio, C.
Veröffentlicht in: PLoS Negl Trop Dis. 2022 Vol. 16 Ausgabe 7
DOI: 10.1371/journal.pntd.0010635
Der Erwerb einer klinisch relevanten Amoxicillin-Resistenz bei Streptococcus pneumoniae erfordert einen geordneten horizontalen Gentransfer von vier Loci
Die Autoren: Gibson, P.S., Bexkens, E., Zuber, S., Cowley, L.A. , und Veening, J.W.
Veröffentlicht in: PLoS Pathogens 2022 Vol. 18 Ausgabe 7
DOI: 10.1371/journal.ppat.1010727
Schaltungsbasierter Entwurf von mikrofluidischen Tropfennetzen
Die Autoren: Rousset, N., Lohasz, C., Boos, J.A., Misun, P.M., Cardes, F., und Hierlemann, A.
Veröffentlicht in: Micromachines 2022 Vol. 13 Ausgabe 7
DOI: 10.3390/mi13071124
Amoxicillin-resistente Streptococcus pneumoniae können durch gezielte Beeinflussung des Mevalonat-Stoffwechsels resensibilisiert werden, wie sCRilecs-seq zeigt
Die Autoren: Dewachter, L., Dénéréaz, J., Liu, X., de Bakker, V., Costa, C., Baldry, M., Sirard, J.C., und Veening, J.W.
Veröffentlicht in: eLife 2022 Vol. 11
DOI: 10.7554/eLife.75607
Mechanismen, die der Bildung und Ausbreitung von Vibrio cholerae-Biofilmen zugrunde liegen
Artikel überprüfen
Die Autoren: Teschler, J.K., Nadell, C.D., Drescher, K., und Yildiz, F.H.
Veröffentlicht in: Annual Review of Microbiology 2022 Vol. 76
DOI: 10.1146/annurev-micro-111021-053553
Pseudomonas aeruginosa kontrahiert Schleim, um schnell Biofilme in gewebetechnisch hergestellten menschlichen Atemwegen zu bilden
Die Autoren: Rossy, T., Distler, T., Pezoldt, J., Kim, J., Talà, J., Bouklas, N., Deplancke, B., und Persat, A.
Vorabdruck: BioRxiv
DOI: 10.1101/2022.05.26.493615
Ausweitung der Suche nach niedermolekularen antibakteriellen Wirkstoffen durch multidimensionales Profiling
Artikel überprüfen
Die Autoren: Ortmayr, K., de la Cruz Moreno, R., und Zampieri, M.
Veröffentlicht in: Nature Chemical Biology 2022 Vol. 18
DOI: 10.1038/s41589-022-01040-4
Hochdurchsatz-Screening von BAM-Inhibitoren in nativer Membranumgebung
Die Autoren: Rath, P., Hermann, A., Schaefer, R., Agustoni, E., Vonach, JM., Siegrist, M., Miscenic, C., Tschumi, A., Roth, D., Bieniossek, C., und Hiller, S.
Vorabdruck: Platz der Forschung
DOI: 10.21203/rs.3.rs-1465417/v1
Kombination von CRISPRi und Metabolomik zur funktionalen Annotation von Substanzbibliotheken
Die Autoren: Anglada-Girotto, M., Handschin, G., Ortmayr, K., Campos, A.I., Gillet, L., Manfredi, P., Mulholland, C.V., Berney, M., Jenal, U., Picotti, P., und Zampieri, M.
Veröffentlicht in: Nature Chemical Biology 2022 Vol. 18
DOI: 10.1038/s41589-022-00970-3
Phage Paride kapert bakterielle Stressreaktionen, um schlafende, antibiotikatolerante Zellen zu töten
Die Autoren: Maffei, E., Burkolter, M., Heyer, Y., Egli, A., Jenal, U., und Harms, A.
Vorabdruck: BioRxiv
DOI: 10.1101/2022.01.26.477855
CRISPRi-seq zur Quantifizierung der genomweiten Fitness bei Bakterien
Autoren: de Bakker, V.*, Liu, X.*, Bravo, A.M., und Veening, J.W.
Veröffentlicht in: Nature Protocols 2022 Vol. 17 Ausgabe 2
DOI: 10.1038/s41596-021-00639-6